MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015184	ATCG	2	8	581768	581775	25 %	25 %	25 %	25 %	325168919
10002	NC_015184	GGC	2	6	581813	581818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168919
10003	NC_015184	CCGG	2	8	581819	581826	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10004	NC_015184	TC	3	6	581842	581847	0 %	50 %	0 %	50 %	325168919
10005	NC_015184	CCG	2	6	581861	581866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10006	NC_015184	AGC	2	6	581897	581902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10007	NC_015184	GC	3	6	581901	581906	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10008	NC_015184	CAT	2	6	581932	581937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
10009	NC_015184	CGTC	2	8	581955	581962	0 %	25 %	25 %	50 %	325168919
10010	NC_015184	TTC	2	6	581978	581983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168919
10011	NC_015184	AAG	2	6	582114	582119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168919
10012	NC_015184	GCA	2	6	582175	582180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10013	NC_015184	TCC	2	6	582195	582200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168919
10014	NC_015184	CAT	2	6	582244	582249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
10015	NC_015184	T	6	6	582355	582360	0 %	100 %	0 %	0 %	325168919
10016	NC_015184	CAC	2	6	582455	582460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168919
10017	NC_015184	CCACG	2	10	582494	582503	20 %	0 %	20 %	60 %	325168919
10018	NC_015184	CGG	2	6	582505	582510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168919
10019	NC_015184	GTC	2	6	582585	582590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10020	NC_015184	AC	3	6	582616	582621	50 %	0 %	0 %	50 %	325168919
10021	NC_015184	GC	3	6	582638	582643	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10022	NC_015184	CTG	2	6	582701	582706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10023	NC_015184	TGT	2	6	582728	582733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168919
10024	NC_015184	GAC	2	6	582809	582814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10025	NC_015184	GCC	2	6	582896	582901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10026	NC_015184	CTGC	2	8	582932	582939	0 %	25 %	25 %	50 %	325168919
10027	NC_015184	CT	3	6	583031	583036	0 %	50 %	0 %	50 %	325168919
10028	NC_015184	GAA	2	6	583118	583123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168919
10029	NC_015184	ATA	2	6	583151	583156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168919
10030	NC_015184	GGCG	2	8	583195	583202	0 %	0 %	75 %	25 %	325168919
10031	NC_015184	GCA	2	6	583272	583277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10032	NC_015184	CAT	2	6	583304	583309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
10033	NC_015184	GGT	2	6	583331	583336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168919
10034	NC_015184	CGA	2	6	583348	583353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10035	NC_015184	CTC	2	6	583400	583405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168919
10036	NC_015184	GCC	2	6	583719	583724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10037	NC_015184	GCC	2	6	583760	583765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10038	NC_015184	CGA	2	6	583855	583860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10039	NC_015184	GC	3	6	583861	583866	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10040	NC_015184	GTCG	2	8	583969	583976	0 %	25 %	50 %	25 %	325168919
10041	NC_015184	ACC	2	6	584064	584069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168919
10042	NC_015184	CCG	2	6	584070	584075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10043	NC_015184	AGA	2	6	584152	584157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168919
10044	NC_015184	AGCG	2	8	584224	584231	25 %	0 %	50 %	25 %	325168919
10045	NC_015184	TTC	2	6	584250	584255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168919
10046	NC_015184	GCC	2	6	584285	584290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
10047	NC_015184	GC	3	6	584400	584405	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10048	NC_015184	GTC	2	6	584418	584423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10049	NC_015184	GGC	2	6	584486	584491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168919
10050	NC_015184	CTG	2	6	584510	584515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
10051	NC_015184	GC	3	6	584559	584564	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
10052	NC_015184	AAC	2	6	584589	584594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168919
10053	NC_015184	TTG	2	6	584737	584742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168920
10054	NC_015184	CGG	2	6	584834	584839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168920
10055	NC_015184	TGA	2	6	584867	584872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168920
10056	NC_015184	TAG	2	6	584881	584886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168920
10057	NC_015184	CG	3	6	584994	584999	0 %	0 %	50 %	50 %	325168920
10058	NC_015184	GGAT	2	8	585007	585014	25 %	25 %	50 %	0 %	325168920
10059	NC_015184	TCA	2	6	585058	585063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168920
10060	NC_015184	GAT	2	6	585072	585077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168920
10061	NC_015184	ACA	2	6	585103	585108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168920
10062	NC_015184	CCG	2	6	585109	585114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168920
10063	NC_015184	GT	3	6	585162	585167	0 %	50 %	50 %	0 %	325168920
10064	NC_015184	CAC	2	6	585198	585203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168920
10065	NC_015184	CG	3	6	585248	585253	0 %	0 %	50 %	50 %	325168920
10066	NC_015184	CTT	2	6	585285	585290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168920
10067	NC_015184	GAGTTC	2	12	585291	585302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325168920
10068	NC_015184	GCC	2	6	585343	585348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168920
10069	NC_015184	TTC	2	6	585363	585368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168920
10070	NC_015184	CAGCG	2	10	585415	585424	20 %	0 %	40 %	40 %	325168920
10071	NC_015184	CTC	2	6	585426	585431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168920
10072	NC_015184	CAGT	2	8	585473	585480	25 %	25 %	25 %	25 %	325168920
10073	NC_015184	GCCGC	2	10	585542	585551	0 %	0 %	40 %	60 %	325168920
10074	NC_015184	AGCG	2	8	585555	585562	25 %	0 %	50 %	25 %	325168920
10075	NC_015184	CTT	2	6	585604	585609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168920
10076	NC_015184	ACC	2	6	585646	585651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168920
10077	NC_015184	C	6	6	585685	585690	0 %	0 %	0 %	100 %	325168920
10078	NC_015184	TGG	2	6	585719	585724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168920
10079	NC_015184	CCA	2	6	585791	585796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168920
10080	NC_015184	CGA	2	6	585803	585808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168920
10081	NC_015184	ACG	2	6	585817	585822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168920
10082	NC_015184	TCG	2	6	585853	585858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168920
10083	NC_015184	CCG	2	6	585871	585876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168920
10084	NC_015184	GCC	2	6	585904	585909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168920
10085	NC_015184	CCT	2	6	585917	585922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168921
10086	NC_015184	GTC	2	6	585925	585930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10087	NC_015184	GCC	2	6	585949	585954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168921
10088	NC_015184	CGG	2	6	585996	586001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168921
10089	NC_015184	T	7	7	586007	586013	0 %	100 %	0 %	0 %	325168921
10090	NC_015184	CCT	3	9	586037	586045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168921
10091	NC_015184	TGC	2	6	586046	586051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10092	NC_015184	CT	3	6	586072	586077	0 %	50 %	0 %	50 %	325168921
10093	NC_015184	ACG	2	6	586081	586086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10094	NC_015184	CGA	3	9	586127	586135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10095	NC_015184	TGC	2	6	586200	586205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10096	NC_015184	GAC	2	6	586224	586229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
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10098	NC_015184	ATC	2	6	586347	586352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168921
10099	NC_015184	AAG	2	6	586377	586382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168921
10100	NC_015184	GTGC	2	8	586394	586401	0 %	25 %	50 %	25 %	325168921
10101	NC_015184	GCCG	2	8	586654	586661	0 %	0 %	50 %	50 %	325168921
10102	NC_015184	AGC	2	6	586686	586691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10103	NC_015184	GAT	2	6	586751	586756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168921
10104	NC_015184	CTG	2	6	586806	586811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10105	NC_015184	CAT	2	6	586851	586856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168921
10106	NC_015184	CGA	2	6	586928	586933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10107	NC_015184	CGG	2	6	586940	586945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168921
10108	NC_015184	GC	3	6	586999	587004	0 %	0 %	50 %	50 %	325168921
10109	NC_015184	CAG	2	6	587021	587026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10110	NC_015184	GCT	2	6	587051	587056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10111	NC_015184	CGA	2	6	587111	587116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10112	NC_015184	GGC	2	6	587157	587162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168921
10113	NC_015184	GAT	2	6	587226	587231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168921
10114	NC_015184	AGA	2	6	587255	587260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168921
10115	NC_015184	GAA	2	6	587277	587282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168921
10116	NC_015184	TGG	2	6	587309	587314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168921
10117	NC_015184	AATG	2	8	587358	587365	50 %	25 %	25 %	0 %	325168921
10118	NC_015184	GAT	2	6	587454	587459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168921
10119	NC_015184	GAT	2	6	587463	587468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168921
10120	NC_015184	GAA	2	6	587499	587504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168921
10121	NC_015184	CAC	2	6	587562	587567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168921
10122	NC_015184	CAA	2	6	587621	587626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168921
10123	NC_015184	CATGA	2	10	587637	587646	40 %	20 %	20 %	20 %	325168921
10124	NC_015184	GAT	2	6	587757	587762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168921
10125	NC_015184	CAG	2	6	587778	587783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10126	NC_015184	TCCT	2	8	587842	587849	0 %	50 %	0 %	50 %	325168921
10127	NC_015184	ACG	2	6	587866	587871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10128	NC_015184	GCT	2	6	587916	587921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10129	NC_015184	GC	3	6	587979	587984	0 %	0 %	50 %	50 %	325168921
10130	NC_015184	GTT	2	6	588026	588031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168921
10131	NC_015184	CCG	2	6	588037	588042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168921
10132	NC_015184	GCA	2	6	588115	588120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10133	NC_015184	CGT	2	6	588141	588146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
10134	NC_015184	GAC	2	6	588179	588184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
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10136	NC_015184	CCA	2	6	588265	588270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168922
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10138	NC_015184	ATC	2	6	588389	588394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
10139	NC_015184	TCC	2	6	588411	588416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168922
10140	NC_015184	GA	3	6	588436	588441	50 %	0 %	50 %	0 %	325168922
10141	NC_015184	GTC	2	6	588446	588451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10142	NC_015184	GCGG	2	8	588468	588475	0 %	0 %	75 %	25 %	325168922
10143	NC_015184	GTC	2	6	588476	588481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10144	NC_015184	CAT	2	6	588533	588538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
10145	NC_015184	GGAT	2	8	588612	588619	25 %	25 %	50 %	0 %	325168922
10146	NC_015184	GCG	2	6	588646	588651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168922
10147	NC_015184	GTAGCT	2	12	588683	588694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325168922
10148	NC_015184	ATCG	2	8	588731	588738	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
10149	NC_015184	AG	3	6	588974	588979	50 %	0 %	50 %	0 %	325168922
10150	NC_015184	TCGA	2	8	588981	588988	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
10151	NC_015184	CAA	2	6	589009	589014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168922
10152	NC_015184	CTG	2	6	589040	589045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10153	NC_015184	GTT	2	6	589059	589064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168922
10154	NC_015184	GCA	2	6	589098	589103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10155	NC_015184	TGC	2	6	589123	589128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10156	NC_015184	GCT	3	9	589160	589168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
10157	NC_015184	AT	3	6	589170	589175	50 %	50 %	0 %	0 %	325168922
10158	NC_015184	GGT	3	9	589217	589225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168922
10159	NC_015184	GTC	2	6	589235	589240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
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10163	NC_015184	TCA	2	6	589581	589586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
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10210	NC_015184	CAG	2	6	593062	593067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168924
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10212	NC_015184	CAAA	2	8	593277	593284	75 %	0 %	0 %	25 %	325168924
10213	NC_015184	GCCG	2	8	594494	594501	0 %	0 %	50 %	50 %	325168925
10214	NC_015184	CGG	2	6	594505	594510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168925
10215	NC_015184	AGAA	2	8	594627	594634	75 %	0 %	25 %	0 %	325168925
10216	NC_015184	GAG	2	6	594653	594658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168925
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10220	NC_015184	GCG	4	12	594846	594857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168925
10221	NC_015184	GC	3	6	594929	594934	0 %	0 %	50 %	50 %	325168925
10222	NC_015184	GAA	3	9	594935	594943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168925
10223	NC_015184	AGC	2	6	595313	595318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
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10225	NC_015184	CCA	2	6	595430	595435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
10226	NC_015184	TCG	2	6	595517	595522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10227	NC_015184	GC	3	6	595541	595546	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
10228	NC_015184	GCC	2	6	595565	595570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168926
10229	NC_015184	CG	3	6	595620	595625	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
10230	NC_015184	GC	3	6	595640	595645	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
10231	NC_015184	ACG	2	6	595757	595762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10232	NC_015184	GC	3	6	595797	595802	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
10233	NC_015184	ACC	2	6	595813	595818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
10234	NC_015184	CAC	2	6	595825	595830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
10235	NC_015184	GCA	2	6	595835	595840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10236	NC_015184	CTC	2	6	595879	595884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168926
10237	NC_015184	AGC	2	6	595886	595891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10238	NC_015184	ACG	2	6	595982	595987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10239	NC_015184	GCT	2	6	596000	596005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168926
10240	NC_015184	CAT	2	6	596019	596024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168926
10241	NC_015184	GAT	2	6	596178	596183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168926
10242	NC_015184	AGCG	2	8	596222	596229	25 %	0 %	50 %	25 %	325168926
10243	NC_015184	CGG	2	6	596248	596253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168926
10244	NC_015184	GCCGC	2	10	596281	596290	0 %	0 %	40 %	60 %	325168926
10245	NC_015184	GAT	2	6	596332	596337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168926
10246	NC_015184	GCTG	2	8	596432	596439	0 %	25 %	50 %	25 %	325168927
10247	NC_015184	CCG	2	6	596508	596513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168927
10248	NC_015184	GA	3	6	596514	596519	50 %	0 %	50 %	0 %	325168927
10249	NC_015184	GCC	3	9	596588	596596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168927
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10314	NC_015184	GAC	2	6	600253	600258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168930
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10317	NC_015184	CGT	2	6	600391	600396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168930
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10319	NC_015184	CGA	2	6	600568	600573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168930
10320	NC_015184	GCC	2	6	600581	600586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168930
10321	NC_015184	CCG	2	6	600622	600627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168930
10322	NC_015184	ATC	2	6	600660	600665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168930
10323	NC_015184	GAC	2	6	600680	600685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168930
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10325	NC_015184	GCA	2	6	600790	600795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168930
10326	NC_015184	CGCAT	2	10	600801	600810	20 %	20 %	20 %	40 %	325168930
10327	NC_015184	GAC	2	6	600923	600928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168930
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10330	NC_015184	CGT	2	6	600988	600993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168930
10331	NC_015184	CGG	2	6	601023	601028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168930

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